在啟動將在完整節點上執行的作業之前，為 SGE 創建一個假作業以填充所有節點

在 SGE 上送出作業以在完整節點上執行的問題在本論壇之前已解決。已經提出了幾種解決方案，其中之一是將 SGE 配置為允許使用選項 -l excl=TRUE，另一種解決方案是向 SGE 詢問硬記憶體或負載限制。

我的碩士論文使用的是我大學的集群，並行環境openmpi配置了填充策略。通常集群的節點每個包含 16 或 20 個核心，問題是一些使用者不是使用 16（或 20）的倍數的核心啟動計算，而是使用任意數量的核心啟動他們的作業. 結果，當我使用 -pe openmpi 16 啟動作業時，有時 SGE 會在 3 個節點（例如 6 + 1 + 10）上保留處理器，這使得計算非常慢。

我要求管理員配置集群以允許 -l excl=TRUE 但他拒絕在進行測試之前更改配置（我不知道多久）。

現在我有了一個新想法，可以讓我得到與 (-l excl=TRUE) 類似的結果，但無需更改集群：

1. 編寫一個腳本，將掃描隊列並估計必須向 SGE 詢問的核心數量，以便他填充所有正在執行的節點並只讓完全空閒的節點。
2. 使用計算出的核心數啟動一個假作業，該作業將等待一定的時間。
3. 啟動我真正的工作（例如 -pe openmpi 2*16=32）。
4. 刪除虛假作業以允許其他使用者使用其核心

有人可以為我提供此類程式碼的範例嗎？

qsub -l cpu=0使用（或）啟動工作cpu=0.1對我來說非常有效。

引用自：https://serverfault.com/questions/901853